RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438219.1

HCFC1-AS1-201, HCFC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCFC1-AS1, Length 350 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ABCF3Q9NUQ8 709 aa13.66□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ASIC3Q9UHC3 531 aa13.66□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PYCARDQ9ULZ3 195 aa13.66□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SPTA1P02549 2419 aa13.66□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.66□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BSNQ9UPA5 3926 aa13.66□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 A0A1W2PPV9 198 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAGEB16A2A368 324 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ARHGEF33A8MVX0 844 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 E5RI56 91 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MKRN2OSH3BPM6 223 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KPNA5O15131 536 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CTSVO60911 334 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HAUS5O94927 633 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RECKO95980 971 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RAB40ALP0C0E4 278 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OGNP20774 298 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AGXTP21549 392 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAGEA3P43357 314 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FNTAP49354 379 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CLCN7P51798 805 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KCNC4Q03721 635 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RAPSNQ13702 412 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ATP1A4Q13733 1029 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MSS51Q4VC12 460 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SUSD1Q6UWL2 747 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TTLL10Q6ZVT0 673 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPIL6Q8IXY8 311 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPFIBP2Q8ND30 876 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FOPNLQ96NB1 174 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PKP4Q99569 1192 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ING2Q9H160 280 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ACSS2Q9NR19 701 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC22A11Q9NSA0 550 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NDOR1Q9UHB4 597 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MED16Q9Y2X0 877 aa13.65□□□□□ -0.22
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 A0A0J9YVX5 310 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C9J4A7 227 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 H3BMM5 538 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PFDN6O15212 129 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 USP1O94782 785 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MATN4O95460 622 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HBQ1P09105 142 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ERVK-10P10266 1014 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ITGAXP20702 1163 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GNG11P61952 73 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DCDP81605 110 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GBX1Q14549 363 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LONRF1Q17RB8 773 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FRMPD2BQ6IN97 320 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RHBDD2Q6NTF9 364 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OR4N4Q8N0Y3 316 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GRK7Q8WTQ7 553 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 THAP4Q8WY91 577 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NDNQ99608 321 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NDC1Q9BTX1 674 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TXLNGQ9NUQ3 528 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa13.64□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MED26O95402 600 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SYF2O95926 243 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PGGT1BP53609 377 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MLLT10P55197 1068 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ADARP55265 1226 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BBS9Q3SYG4 887 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TCTN3Q6NUS6 607 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TLDC1Q6P9B6 456 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CPNE9Q8IYJ1 553 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OR2L3Q8NG85 312 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OR9A1PQ8NGU1 263 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GPR21Q99679 349 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa13.63□□□□□ -0.23
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CLMPQ9H6B4 373 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms