RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 MFSD4AQ8N468 514 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 SP140LQ9H930 580 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.44■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 AGAP14A8MT82 685 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 TAF4O00268 1085 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 SLC16A5O15375 505 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 NOBOXO60393 691 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 INMTO95050 263 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PRAMEF1O95521 474 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ASGR1P07306 291 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 C8GP07360 202 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PTPN6P29350 595 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 HPCAL1P37235 193 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 NFATC2Q13469 925 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 SIGLEC11Q96RL6 698 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 KRBA1A5PL33 1030 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 H0Y626 953 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 HOXA2O43364 376 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 UGDHO60701 494 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM16O95361 564 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 VNN2O95498 520 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ALDH1A1P00352 501 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 CTPS1P17812 591 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PRPS1L1P21108 318 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 AGXTP21549 392 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ITGA1P56199 1179 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 RHOAP61586 193 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 NPTX1Q15818 432 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 CES5AQ6NT32 575 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ADCK1Q86TW2 530 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 EXOC2Q96KP1 924 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 MMP27Q9H306 513 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.43■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 AREL1O15033 823 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 STC2O76061 302 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 CD160O95971 181 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 FABP3P05413 133 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 MPC1LP0DKB6 136 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 GPX2P18283 190 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 TGM1P22735 817 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 SPAM1P38567 509 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 CCR3P51677 355 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 RAPSNQ13702 412 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 CLCA4Q14CN2 919 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 NEK5Q6P3R8 708 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 FAHD1Q6P587 224 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 NETO1Q8TDF5 533 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 LYSMD1Q96S90 227 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 EPYCQ99645 322 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.42■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.41■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.41■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 A8MVJ9 347 aa16.41■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.41■□□□□ 0.22
HCLS1-202ENST00000428394 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms