RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ALG2Q9H553 416 aa22.53■■□□□ 1.2
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FAAP20-209ENST00000428120 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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FAAP20-209ENST00000428120 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.52■■□□□ 1.2
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FAAP20-209ENST00000428120 SMU1Q2TAY7 513 aa22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 APOLD1Q96LR9 279 aa22.51■■□□□ 1.19
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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FAAP20-209ENST00000428120 OR2T3Q8NH03 318 aa22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 OR2L2Q8NH16 312 aa22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 OR56A3Q8NH54 315 aa22.5■■□□□ 1.19
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 OR1A2Q9Y585 309 aa22.5■■□□□ 1.19
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FAAP20-209ENST00000428120 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.49■■□□□ 1.19
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FAAP20-209ENST00000428120 ASIC5Q9NY37 505 aa22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 GPR34Q9UPC5 381 aa22.49■■□□□ 1.19
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FAAP20-209ENST00000428120 LRATO95237 230 aa22.49■■□□□ 1.19
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FAAP20-209ENST00000428120 RPS14P62263 151 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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FAAP20-209ENST00000428120 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 MGAT4DA6NG13 374 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 ADH1BP00325 375 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 SDC1P18827 310 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK9P45984 424 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 INPP5AQ14642 412 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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