RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANXA6P08133 673 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JUPP14923 745 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYOGP15173 224 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTT1P30711 240 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PREPP48147 710 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METAP1P53582 386 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHC1P78364 1004 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOFQ13790 326 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRSN1Q8IZ57 195 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM9CQ8IZT9 166 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APIPQ96GX9 242 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF145Q96MT1 663 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSSK3Q96PN8 268 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHID1Q9BWS9 393 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM4Q9C037 500 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C8orf4Q9NR00 106 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPP7Q9UHL4 492 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMED5Q9Y3A6 229 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRRT4C9JH25 899 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMD11O00231 422 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLOD2O00469 737 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPINT1O43278 529 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LDLRP01130 860 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDC1P18827 310 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TACR1P25103 407 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYCR3Q53H96 274 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RUNDC3AQ59EK9 446 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT80Q6KB66 452 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10A6Q8NH74 314 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3GL1Q99961 368 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCM2Q9BSQ5 444 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFA13Q9P0J0 144 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRK1Q38SD2 2015 aa18.19■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC5A10A0PJK1 596 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGDHO60701 494 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRNPP04156 253 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1B1P15313 513 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD22P20273 847 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK1P28482 360 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRF8Q02556 426 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTDC1Q4AE62 458 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIPJQ5W064 366 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXJ1Q92949 421 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DTD2Q96FN9 168 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFYVE19Q96K21 471 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COQ10AQ96MF6 247 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GORASP2Q9H8Y8 452 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERHLQ9NQF3 203 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A13Q9NSD5 602 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNPLA3Q9NST1 481 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PADI4Q9UM07 663 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EI24O14681 340 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GMNNO75496 209 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RB1P06400 928 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C7P10643 843 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACPPP15309 386 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMD1P17707 334 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGTRAPQ6RW13 159 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF175Q8N4F7 328 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL25Q8N6Q8 603 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNIP2Q8NFZ5 429 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATL1Q8WXF7 558 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TESCQ96BS2 214 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOLD1Q96LR9 279 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC138Q96M89 665 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADI1Q9BV57 179 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPT2Q9UMR5 302 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.18■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GTW7 788 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0Y858 1186 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLGNO14967 610 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERN1O75460 977 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CATP04040 527 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-EP13747 358 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S100A3P33764 101 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A11P48066 632 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCSMST1Q4G0I0 132 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XKR6Q5GH73 641 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM220Q6QAJ8 160 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC22A15Q8IZD6 547 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FIG4Q92562 907 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms