RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 RPTNQ6XPR3 784 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF767PQ75MW2 155 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF276Q8N554 614 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TERB2Q8NHR7 220 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 STAG3L4Q8TBR4 150 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FCGR1BQ92637 280 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CREB3L1Q96BA8 519 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TCEAL4Q96EI5 215 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PAFAH2Q99487 392 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC32A1Q9H598 525 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NMUR1Q9HB89 426 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C19orf12Q9NSK7 152 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TAS2R7Q9NYW3 318 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM216Q9P0N5 145 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KLQ9UEF7 1012 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FZD10Q9ULW2 581 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CA5BQ9Y2D0 317 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 BTNL10A8MVZ5 291 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 M0QZQ0 153 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LIASO43766 372 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PLIN3O60664 434 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP11A1P05108 521 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IFI30P13284 250 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GRIA1P42261 906 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DCDC1P59894 354 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF45Q02386 682 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GBE1Q04446 702 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RING1Q06587 406 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXM1Q08050 763 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFA9Q16795 377 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 STYXQ8WUJ0 223 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PYDC1Q8WXC3 89 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FGF13Q92913 245 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C3orf49Q96BT1 292 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TLR10Q9BXR5 811 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DPY30Q9C005 99 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RASSF1Q9NS23 344 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 H3BNC9 293 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CHST10O43529 356 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HCRTO43612 131 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CRYZL1O95825 349 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HLA-EP13747 358 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRKCAP17252 672 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OGNP20774 298 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP4F2P78329 520 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PITPNAQ00169 270 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP4F3Q08477 520 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NOMO1Q15155 1222 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NR6A1Q15406 480 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CARTPTQ16568 116 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AMZ1Q400G9 498 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CORO6Q6QEF8 472 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PARGQ86W56 976 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GKN2Q86XP6 184 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TIGD4Q8IY51 512 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DEFB119Q8N690 84 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LCN9Q8WX39 176 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SPOCK2Q92563 424 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NUS1Q96E22 293 aa4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms