RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 PPP1CAP62136 330 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 FMO1Q01740 532 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 LONRF1Q17RB8 773 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 BOLA3Q53S33 107 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 CES4AQ5XG92 561 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 LCN10Q6JVE6 187 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 OR1L3Q8NH93 324 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 LCN9Q8WX39 176 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 DLG3Q92796 817 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 ZNF653Q96CK0 615 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 C12orf66Q96MD2 445 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 NUP85Q9BW27 656 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 STMN3Q9NZ72 180 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 RNF112Q9ULX5 631 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CASP4-201ENST00000393150 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 LCA5LO95447 670 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CAPN1P07384 714 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FDXRP22570 491 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MMP11P24347 488 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FOLH1Q04609 750 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ABRQ12979 859 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MFAP5Q13361 173 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KRT81Q14533 505 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PTPRRQ15256 657 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 RBBP7Q16576 425 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 C1orf189Q5VU69 101 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PGBD5Q8N414 524 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 NPWQ8N729 165 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZNF559Q9BR84 538 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ABI3Q9P2A4 366 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 C2orf74A8MZ97 194 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KDM1AO60341 852 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 SLC19A2O60779 497 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MTX2O75431 263 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ZWINTO95229 277 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KLK2P20151 261 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MSH3P20585 1137 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ARSFP54793 590 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 DMPKQ09013 629 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 Q0VFX4 171 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 GALNT3Q14435 633 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 BECN1Q14457 450 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 FAM209AQ5JX71 171 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 TEX26Q8N6G2 289 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 MLKLQ8NB16 471 aa7.57□□□□□ -1.2
CASP4-201ENST00000393150 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms