RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384406.1

RNU6-452P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 452, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-452P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-452P-201ENST00000384406 A0A0U1RQJ8 604 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CFAP73A6NFT4 308 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 BECN2A8MW95 431 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 KPNA7A9QM74 516 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 HSF2BPO75031 334 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TGFAP01135 160 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CCND2P30279 289 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 RUNX1T1Q06455 604 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 SULT2A1Q06520 285 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CA9Q16790 459 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 FAM166AQ6J272 317 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PIP4P1Q86T03 277 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CCNYQ8ND76 341 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 IPMKQ8NFU5 416 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 SAMD8Q96LT4 415 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 RASL10BQ96S79 203 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 C17orf62Q9BQA9 187 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 ZNF559Q9BR84 538 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CDK19Q9BWU1 502 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 DPH5Q9H2P9 285 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TMEM245Q9H330 911 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 FZD10Q9ULW2 581 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 DUSP12Q9UNI6 340 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 LILRA5A6NI73 299 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TLR4O00206 839 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 RGS14O43566 566 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 SSX5O60225 188 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PEX11AO75192 247 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CXCL14O95715 111 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 IFNB1P01574 187 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CSF2RAP15509 400 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 OR3A1P47881 315 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 SMSP52788 366 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PRKAA1Q13131 559 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 GPS2Q13227 327 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 DPYSQ14117 519 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 ZNF234Q14588 700 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TEX35Q5T0J7 233 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TRNP1Q6NT89 227 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 DNAJC10Q8IXB1 793 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 TMEM199Q8N511 208 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 RDM1Q8NG50 284 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 WASF1Q92558 559 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 FIG4Q92562 907 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PYCR2Q96C36 320 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 C14orf79Q96F83 325 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 IKBKGQ9Y6K9 419 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-452P-201ENST00000384406 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 A0A087X0K7 114 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 F8VVB4 439 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 F8VWA3 439 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 H0YIG0 161 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 SNX3O60493 162 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 SERPINI2O75830 405 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-452P-201ENST00000384406 MMP10P09238 476 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms