RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384227.1

RNU6-1201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1201P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GCNT1Q02742 428 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PSG7Q13046 419 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C16orf72Q14CZ0 275 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HERC3Q15034 1050 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DLG2Q15700 870 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ISXQ2M1V0 245 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM44Q2T9K0 475 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF506Q5JVG8 444 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LRRC31Q6UY01 552 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LINGO4Q6UY18 593 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LEKR1Q6ZMV7 388 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TPRG1Q6ZUI0 275 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NAXDQ8IW45 347 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CDK20Q8IZL9 346 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR5T2Q8NGG2 359 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR52N5Q8NH56 324 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RNF128Q8TEB7 428 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 JDP2Q8WYK2 163 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLCO4A1Q96BD0 722 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HDAC11Q96DB2 347 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM68Q96MH6 324 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RANBP9Q96S59 729 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EPB41L5Q9HCM4 733 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 INPP5EQ9NRR6 644 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NPAP1Q9NZP6 1156 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 THYN1Q9P016 225 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRODH2Q9UF12 536 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TSPYL4Q9UJ04 414 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NOTCH1P46531 2555 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TXNL1O43396 289 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TSPAN3O60637 253 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGLV1-47P01700 117 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 S100BP04271 92 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ARL14EPLP0DKL9 152 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CD99P14209 185 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 COX7A2P14406 83 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CPN1P15169 458 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PTGDSP41222 190 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NDST2P52849 883 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IST1P53990 364 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MAZP56270 477 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 UFM1P61960 85 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FUT7Q11130 342 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GAGE2BQ13066 116 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM132DQ14C87 1099 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LY6EQ16553 131 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TAZQ16635 292 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GSG1Q2KHT4 349 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GAGE2EQ4V326 116 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NHLRC3Q5JS37 347 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FBXO47Q5MNV8 452 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GAGE2AQ6NT46 116 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CGB2Q6NT52 195 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGFL1Q6UW32 110 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CEP97Q8IW35 865 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TSPYL6Q8N831 410 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF491Q8N8L2 437 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GTF3C6Q969F1 213 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IL22RA2Q969J5 263 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RILPL2Q969X0 211 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TBC1D20Q96BZ9 403 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MTERF3Q96E29 417 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C2orf48Q96LS8 159 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IMMP1LQ96LU5 166 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OLFM1Q99784 485 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NLGN3Q9NZ94 848 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HCN3Q9P1Z3 774 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GAGE2DQ9UEU5 116 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MTUS1Q9ULD2 1270 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MMACHCQ9Y4U1 282 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MEGF6O75095 1541 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms