RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 MATN2O00339 956 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR47O94967 919 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 RXRGP48443 463 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 IDH3AP50213 366 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNLIPRP1P54315 467 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTF2H2Q13888 395 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC6Q16204 474 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 HLA-BQ31612 363 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SH2D4BQ5SQS7 431 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 CUZD1Q86UP6 607 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC37A2Q8TED4 501 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRFN3Q9BTN0 628 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC32A1Q9H598 525 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC22A14Q9Y267 594 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0G2JNG1 304 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5K4A6NMS3 321 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIR2DS3K7RE56 304 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIR2DS5Q14953 304 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM48Q8IWZ4 208 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A45Q8N413 288 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SFRP1Q8N474 314 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR56A3Q8NH54 315 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMOC1Q9H4F8 434 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 XKR8Q9H6D3 395 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPNE7Q9UBL6 633 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC6A14Q9UN76 642 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLCO1B7G3V0H7 640 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 HDAC3O15379 428 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPN2O95208 641 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 NDUFS1P28331 727 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF423Q2M1K9 1284 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC23A3Q6PIS1 610 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPGNQ6UW88 154 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOXL4Q96JB6 756 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL21RQ9HBE5 538 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 VTI1BQ9UEU0 232 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1B0GTL3 188 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 E7ENX8 843 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 DIAPH2O60879 1101 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 VIPP01282 170 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANXA6P08133 673 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERGP11308 486 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC2A4P14672 509 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAP2Q03519 686 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLNKQ7Z7G1 428 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAPK15Q8TD08 544 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC40A1Q9NP59 571 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA7Q9P0W8 599 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB23Q9ULC3 237 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 MPLP40238 635 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBPL1P62380 186 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 LCP2Q13094 533 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TUBB3Q13509 450 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBBP7Q16576 425 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUSD1Q6UWL2 747 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAREM1Q9H706 876 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 IPPKQ9H8X2 491 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ICKQ9UPZ9 632 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1B0GTQ1 180 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM233B4DJY2 109 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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TRAPPC10-202ENST00000380221 SH3BP2P78314 561 aa26.84■■□□□ 1.89
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TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP2A13Q16696 494 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM219BQ5XKK7 198 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52B6Q8NGF0 335 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 NMUR2Q9GZQ4 415 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 POT1Q9NUX5 634 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC12A4Q9UP95 1085 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCHO1O14526 889 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR7A17O14581 309 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPB42P16452 691 aa26.84■■□□□ 1.89
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