RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTHFRP42898 656 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAX9P55771 341 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSDMDP57764 484 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 HERC3Q15034 1050 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 E2F5Q15329 346 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CA9Q16790 459 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 XKR3Q5GH77 459 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCN1P1Q5VSP4 162 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD12Q6NUT3 480 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOGA1Q86XE5 327 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMPERQ8N8U9 685 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN14Q8NG11 270 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP45Q92619 1136 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 AZIN2Q96A70 460 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT12Q99456 494 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGCR6LQ9BY27 220 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL4Q9C0H6 718 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASIC3Q9UHC3 531 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMED3Q9Y3Q3 217 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPE2 198 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PR64 198 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHB6O15197 1021 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM20O43506 726 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEC1O60732 1142 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLRA3O75311 464 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK2AP2O75956 126 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 STARD3NLO95772 234 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB40ALP0C0E4 278 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINGO3P0C6S8 592 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 LBX1P52954 281 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCNT1Q02742 428 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL11RAQ14626 422 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNIP1Q15025 636 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35D3Q5M8T2 416 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 WLSQ5T9L3 541 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM207Q6UWW9 146 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTN2A1Q7KYR7 527 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMD2Q8IY49 270 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 THAP8Q8NA92 274 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEKT4Q8WW24 435 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATL1Q8WXF7 558 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 NSMCE3Q96MG7 304 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM20AQ96MK3 541 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP28Q96RU2 1077 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC106Q9BWC9 280 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOL6Q9BWW8 343 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHARPINQ9H0F6 387 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYNNQ9NPC7 610 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAO2Q9NYQ3 351 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL17BQ9UHF5 180 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC24A2Q9UI40 661 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEMP2A6NFY4 417 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARPC2O15144 300 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDHD2O94830 711 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC24AO95486 1093 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV2-70P01814 119 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DARSP14868 501 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPZP25189 248 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 OPRL1P41146 370 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPK12P53778 367 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GUCY2DQ02846 1103 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DRP2Q13474 957 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHKG1Q16816 387 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMP2KLQ5H9B9 411 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GARNL3Q5VVW2 1013 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOK6Q6PKX4 331 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 G2E3Q7L622 706 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUP54Q7Z3B4 507 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMKMTQ7Z624 323 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRTM1Q86UE6 522 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 AVL9Q8NBF6 648 aa2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 262.6 ms