RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 NCK1P16333 377 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 HKDC1Q2TB90 917 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB7BQ96AH8 199 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CHID1Q9BWS9 393 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CKLFQ9UBR5 152 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2QL1A1L167 161 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 hCG_2039718K7EN88 272 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 OAZ2O95190 189 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ALPPP05187 535 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CCKBRP32239 447 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GRK6P43250 576 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM198Q66K66 360 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 DMTF1Q9Y222 760 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JN53 185 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MUI8 341 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GRID2O43424 1007 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZVL8 140 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 H0YC42 278 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FADS2O95864 444 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 EBLN1P0CF75 366 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDH1Q08174 1060 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GRM2Q14416 872 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 RELL1Q8IUW5 271 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0J9YVX5 310 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 STX16O14662 325 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-EP13747 358 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MYADML2A6NDP7 307 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BNX3 289 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 RPP38P78345 283 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SCAPQ12770 1279 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PYDC2Q56P42 97 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MORN1Q5T089 497 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 C9J4A7 227 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ALOX5P09917 674 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LIN54Q6MZP7 749 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ATCAYQ86WG3 371 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR65Q8IYL9 337 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPV1Q8NER1 839 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPV3Q8NET8 790 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ITM2AO43736 263 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 BEST1O76090 585 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PROZP22891 400 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 BDKRB1P46663 353 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCN7P51798 805 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KBTBD6Q86V97 674 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4C6Q8NH72 309 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX33Q8WV41 574 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK6Q9Y257 313 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CLIC1O00299 241 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFS4O43181 175 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OLIG2Q13516 323 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms