RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343380.5

E2F1-201, Transcript of E2F transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1-201ENST00000343380 GSTT2P0CG29 244 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 GSTT2BP0CG30 244 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 KRT20P35900 424 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 TGFBR2P37173 567 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 VLDLRP98155 873 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SLC13A2Q13183 592 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 OR2T29Q8NH02 315 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SIRT5Q9NXA8 310 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ILVBLA1L0T0 632 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ATF6P18850 670 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 S100A3P33764 101 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CARTPTQ16568 116 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SETD9Q8NE22 299 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ULK4Q96C45 1275 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 PARVBQ9HBI1 364 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 A8MU76 341 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 IL1RNP18510 177 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 BCL7BQ9BQE9 202 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 NTMT1Q9BV86 223 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SPC25Q9HBM1 224 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CLDN11O75508 207 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SEC24AO95486 1093 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ASGR1P07306 291 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CTGFP29279 349 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 HMGCLP35914 325 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SLC11A2P49281 568 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ARHGEF7Q14155 803 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 NACA2Q9H009 215 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 DSN1Q9H410 356 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ASIC5Q9NY37 505 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 LHX3Q9UBR4 397 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 VPS51Q9UID3 782 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 VPS4AQ9UN37 437 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 RGS10O43665 173 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 NBNO60934 754 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 FAM20BO75063 409 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 MYO1DO94832 1006 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 EBLN1P0CF75 366 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 EPB42P16452 691 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CD40LGP29965 261 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CLDN8P56748 225 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SELENBP1Q13228 472 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 KEAP1Q14145 624 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SYT16Q17RD7 645 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 AHSA2Q719I0 299 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ASB8Q9H765 288 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SCN3BQ9NY72 215 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 A8MX80 341 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 WNT9AO14904 365 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 PCDHGA12O60330 932 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 FZD6O60353 706 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ALOX5P09917 674 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CD36P16671 472 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 RGS4P49798 205 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 CREMQ03060 361 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 ABHD18Q0P651 414 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 KCNJ8Q15842 424 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F1-201ENST00000343380 SMU1Q2TAY7 513 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms