RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2A13Q16696 494 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT7Q86SF2 657 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC22Q8N4W6 341 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB42Q8N4Z0 105 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO36Q8NEA4 188 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR9A1PQ8NGU1 263 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCMTD2Q9NV79 361 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERTAD3Q9UJW9 196 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 C21orf140B9A014 251 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 E7EQ34 232 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDC80O14777 642 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHSGP02765 367 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CATP04040 527 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBSLP0DN79 551 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCN2P20062 427 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBSP35520 551 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBLBQ13191 982 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUPD1Q68J44 220 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSELQ8IZU8 1212 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXD3Q8N9H8 876 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBOF1Q8ND07 529 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MR1Q95460 341 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLIP3Q96DZ5 547 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRHL1Q9NZI5 618 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 WHRNQ9P202 907 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCND3Q9UK17 655 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEN1O00255 615 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF749O43361 778 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 KATNA1O75449 491 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2B3O76000 313 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP9O95302 570 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCM3P25205 808 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKN2DP55273 166 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MC1RQ01726 317 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCRL6Q6DN72 434 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCN10Q6JVE6 187 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf46Q6P387 395 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYHR1Q6ZMK1 362 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB11Q8WXH4 323 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKP4Q99569 1192 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHST8Q9H2A9 424 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLCL2Q9UPR0 1127 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFYI3L273 518 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALCOCO2Q13137 446 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 BORAQ6PGQ7 559 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM198BQ6UWH4 519 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYTL1Q8IYJ3 562 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR135Q8IZ08 494 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2L3Q8NG85 312 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2A1Q8NGT9 310 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CATSPER2Q96P56 530 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIPEPQ99797 713 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTL8Q9H568 366 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 EURLQ9NYK6 297 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK4Q9Y5K2 254 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCM1Q15154 2024 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPTA1P02549 2419 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CREG1O75629 220 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM87AP0C7U9 286 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIA3P42263 894 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS18P62269 152 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP19Q14CB8 494 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT3A1Q6NUS8 523 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FIGLAQ6QHK4 219 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED8Q96G25 268 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR87Q9BY21 358 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOCS1Q9NZB8 636 aa18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms