RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf66Q96MD2 445 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 H0YGN5 161 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PDLIM1O00151 329 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 KCNE1P15382 129 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 INCA1Q0VD86 236 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 NFS1Q9Y697 457 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN7O94888 489 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TBX18O95935 607 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A6P19224 532 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GSTM3P21266 225 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A1P22309 533 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A4P22310 534 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A3P35503 534 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TPTEP56180 551 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 DSTNP60981 165 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PIGKQ92643 395 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF10O60809 474 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 XKP51811 444 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TCF7L1Q9HCS4 588 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM233B4DJY2 109 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CCR8P51685 355 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00471Q8N535 108 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 DERL2Q9GZP9 239 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ACOX3O15254 700 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ALAS2P22557 587 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TUBA4AP68366 448 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK1Q14012 370 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 HERVK_113Q902F9 699 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FATE1Q969F0 183 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PKP2Q99959 881 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 NPPAP01160 153 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TP53INP1Q96A56 240 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PYCR2Q96C36 320 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CDH7Q9ULB5 785 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GMEB1Q9Y692 573 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 AMBNQ9NP70 447 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD3Q9UBI1 195 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC42Q9Y546 428 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM17P78536 824 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PAMR1Q6UXH9 720 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 VITQ6UXI7 678 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL36Q8N4N3 616 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD7Q96MP8 289 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 COL21A1Q96P44 957 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 LCHNA4D1U4 455 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 AGR2O95994 175 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1D1P51857 326 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 RBBP4Q09028 425 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ANO7Q6IWH7 933 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 NPY6RQ99463 290 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A4Q9H015 551 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 EHD1Q9H4M9 534 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHA1Q9HB21 404 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SNED1Q8TER0 1413 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD18Q0P651 414 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MADCAM1Q13477 382 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PCLAFQ15004 111 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms