RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 SCML1Q9UN30 329 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ERVK-11Q9UQG0 969 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 VWA7Q9Y334 891 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FAM170BA6NMN3 283 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF839A8K0R7 811 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35E2BP0CK96 405 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 STMN1P16949 149 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MATN1P21941 496 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PRKAA1Q13131 559 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF284Q2VY69 593 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CTSL3PQ5NE16 218 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FAM45BPQ6NSW5 357 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA6LQ8N4H0 392 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FAM110BQ8TC76 370 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FAM45AQ8TCE6 357 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NUS1Q96E22 293 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 P2RY12Q9H244 342 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NANOGQ9H9S0 305 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CD320Q9NPF0 282 aa19.82■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM233B4DJY2 109 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH8O95206 1070 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MERTKQ12866 999 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 HERC3Q15034 1050 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FRA10AC1Q70Z53 315 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PIM3Q86V86 326 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 OFCC1Q8IZS5 231 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 LSMEM2Q8N112 164 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PELI3Q8N2H9 469 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL20Q96IG2 436 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ASB2Q96Q27 587 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM9Q9P0T7 183 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MID2Q9UJV3 735 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MED16Q9Y2X0 877 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FDXRP22570 491 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NR4A1P22736 598 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 IDUAP35475 653 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 YAP1P46937 504 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ADPRHP54922 357 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SLC12A2P55011 1212 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GK5Q6ZS86 529 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SYT13Q7L8C5 426 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RBFAQ8N0V3 343 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ANKFN1Q8N957 763 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 OR14C36Q8NHC7 312 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ULK4Q96C45 1275 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TSNARE1Q96NA8 513 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D17Q9HA65 648 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NUMA1Q14980 2115 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 VCANP13611 3396 aa19.81■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 IGLON5A6NGN9 336 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 DLGAP1O14490 977 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A2O15244 555 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GMNNO75496 209 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 MYO1DO94832 1006 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 APOA4P06727 396 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CCNYL1Q8N7R7 359 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 HMGB4Q8WW32 186 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL3Q9UH77 587 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM64A6NGJ6 449 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ACADMP11310 421 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 OPRL1P41146 370 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TIGD2Q4W5G0 525 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 GPRC6AQ5T6X5 926 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 USP30Q70CQ3 517 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF765Q7L2R6 523 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FAM124AQ86V42 546 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PSD2Q9BQI7 771 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 FZD4Q9ULV1 537 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS21Q9Y6M0 314 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 TRPM6Q9BX84 2022 aa19.8■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 K7ESM1 405 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SOD1P00441 154 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 PKMP14618 531 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 B4GALNT1Q00973 533 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFA5Q16718 116 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 SNX29P2Q8IUI4 249 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN19Q8N6F1 224 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-201ENST00000265339 RDH11Q8TC12 318 aa19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms