RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261177.9

TSPAN11-201, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN11, Length 5,505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 IL36AQ9UHA7 158 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FABP12A6NFH5 140 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SNAPC5O75971 98 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NPPAP01160 153 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NRLP54845 237 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 USP30Q70CQ3 517 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NUDT13Q86X67 352 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 AASSQ9UDR5 926 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MATN4O95460 622 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SERINC3Q13530 473 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CARTPTQ16568 116 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 OSTM1Q86WC4 334 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CRELD1Q96HD1 420 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SIX4Q9UIU6 781 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 DUXAA6NLW8 204 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 C9IYK1 514 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NOBOXO60393 691 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 IFNA7P01567 189 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 GSTT2BP0CG30 244 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TFPIP10646 304 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CCR8P51685 355 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 GJA9P57773 515 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 DNAJB13P59910 316 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 VITQ6UXI7 678 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 UFD1Q92890 307 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SYT17Q9BSW7 474 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 J3KR12 359 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 KDELR3O43731 214 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CYP11A1P05108 521 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ALPPP05187 535 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF30P17039 623 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ATP4BP51164 291 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MYBPC3Q14896 1274 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM129CQ86XR2 697 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 EXO5Q9H790 373 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 NFKBIEO00221 500 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TBX1O43435 398 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TUBA1BP68363 451 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 GRB14Q14449 540 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TUBA1AQ71U36 451 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 LMO3Q8TAP4 145 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ING5Q8WYH8 240 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 HERVK_113Q902F9 699 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 C12orf66Q96MD2 445 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 IFNA6P05013 189 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CPN2P22792 545 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FRG2Q64ET8 278 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 OR4C6Q8NH72 309 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 FRG2BQ96QU4 278 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TCHHQ07283 1943 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ARVCFO00192 962 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 MAGEA11P43364 429 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ALDH3A2P51648 485 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 PCLAFQ15004 111 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 IFNL1Q8IU54 200 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CAPNS2Q96L46 248 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 SMOQ99835 787 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 LCHNA4D1U4 455 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN11-201ENST00000261177 TSPAN4O14817 238 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms