RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD28O15084 1053 aa16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RGS14O43566 566 aa16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIB3Q96RU7 358 aa16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 M0QZQ0 153 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 SAP18O00422 153 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ELNP15502 786 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 CLCN7P51798 805 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 DGUOKQ16854 277 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 SCN3BQ9NY72 215 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 C2orf78A6NCI8 922 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RGS5O15539 181 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 MSH3P20585 1137 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 CD6P30203 668 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT20P35900 424 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 SUOXP51687 545 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 OXA1LQ15070 435 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 P3H2Q8IVL5 708 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 C1orf109Q9NX04 203 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 IL37Q9NZH6 218 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 COQ9O75208 318 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PCMT1P22061 227 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 LIPAP38571 399 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNA10Q16322 511 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RTP2Q5QGT7 225 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TERB1Q8NA31 727 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ACPTQ9BZG2 426 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 STX16O14662 325 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC10A3P09131 477 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 EPB42P16452 691 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GADD45AP24522 165 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GBX1Q14549 363 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 CHRNA6Q15825 494 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF691Q5VV52 312 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 BEND5Q7L4P6 421 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 HMGN2P46Q86SG4 172 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 BEX2Q9BXY8 128 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 OR51E2Q9H255 320 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RMI1Q9H9A7 625 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF639Q9UID6 485 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC22A14Q9Y267 594 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM64A6NGJ6 449 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ACSL4O60488 711 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR47O94967 919 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ENGP17813 658 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TGM4P49221 684 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGDIAP52565 204 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 DMC1Q14565 340 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR150Q8NGU9 434 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PYURFQ96I23 114 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 CORO1BQ9BR76 489 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR83Q9NYM4 423 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PPT2Q9UMR5 302 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TBL1XO60907 577 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 MFN2O95140 757 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PLD1Q13393 1074 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PSKH2Q96QS6 385 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TUBA1CQ9BQE3 449 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF38Q9H0F5 515 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 EHD1Q9H4M9 534 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RAD18Q9NS91 495 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RGS10O43665 173 aa16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TRPC1P48995 793 aa16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RPP38P78345 283 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 DNASE1L2Q92874 299 aa16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 MED8Q96G25 268 aa16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TTPALQ9BTX7 342 aa16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms