RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LCA5Q86VQ0 697 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC30BQ8N4P2 665 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TCF12Q99081 682 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR22Q99680 433 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 PYGBP11216 843 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A4P14672 509 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGCLP35914 325 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCRFS1P47985 274 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXM1Q08050 763 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MRNIPQ6NTE8 343 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 DCDC2Q9UHG0 476 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TLK1Q9UKI8 766 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL5AQ9Y689 179 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CHUKO15111 745 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TYRP1P17643 537 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 OGNP20774 298 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CILP2Q8IUL8 1156 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TGM7Q96PF1 710 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C1Q96RD1 312 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 KLC4Q9NSK0 619 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 RGSL1A5PLK6 1076 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 COPEO14579 308 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0754O94854 1291 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN7O94888 489 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTA1P08263 222 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF5P12034 268 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRB3P28472 473 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CD151P48509 253 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPHS1P49903 392 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB8P50452 374 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 BMPR2Q13873 1038 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB18Q6ZVZ8 466 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4L1Q8NH43 312 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL6Q8WZ60 621 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 RSC1A1Q92681 617 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS39Q96JC1 886 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2AG1Q9H205 316 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS11Q9H270 941 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 IL17CQ9P0M4 197 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 POLHQ9Y253 713 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO9AB2RTY4 2548 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ITPR2Q14571 2701 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GMNCA6NCL1 334 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 MKRN2OSH3BPM6 223 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SPAG7O75391 227 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TIAF1O95411 115 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DHRS4L1P0CG22 281 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR4P57081 412 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 IL11RAQ14626 422 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF470Q6ECI4 717 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS42Q7Z5A4 293 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF547Q8IVP9 402 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX19Q8NA77 164 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 AVL9Q8NBF6 648 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR26Q8NDV2 337 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TCP10LQ8TDR4 215 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM55Q9BYV6 548 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PKD2L2Q9NZM6 624 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GRID1Q9ULK0 1009 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PLLPQ9Y342 182 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF711Q9Y462 761 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC78A2IDD5 438 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC162PA2VCL2 907 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 STX7O15400 261 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB5O75953 348 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 S1PR4O95977 384 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 COL6A2P12110 1019 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TYK2P29597 1187 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC1A2P43004 574 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ETV4P43268 484 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 POU4F1Q01851 419 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 C4orf17Q53FE4 359 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms