RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621948.4

GTF2IP1-208, Transcript of general transcription factor IIi pseudogene 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2IP1, Length 2,844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP1-208ENST00000621948 GPR153Q6NV75 609 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 GDPD3Q7L5L3 318 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 RNF149Q8NC42 400 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 MARVELD3Q96A59 401 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ELMO2Q96JJ3 720 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 GLOD4Q9HC38 313 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CTSFQ9UBX1 484 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 LCTP09848 1927 aa10□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 URADA6NGE7 173 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PCDHGA12O60330 932 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 SPAG6O75602 509 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 APOL3O95236 402 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CCDC130P13994 396 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 BGNP21810 368 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 TNFSF4P23510 183 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 TACR3P29371 465 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 SLC1A6P48664 564 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CDH8P55286 799 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 GMFBP60983 142 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 VAMP2P63027 116 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PUDPQ08623 228 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 KCNJ11Q14654 390 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 NOMO1Q15155 1222 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 BEX5Q5H9J7 111 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 NPNTQ6UXI9 565 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 AP2M1Q96CW1 435 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 FOPNLQ96NB1 174 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 SARDHQ9UL12 918 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 SCML1Q9UN30 329 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 FZD1Q9UP38 647 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 EFCAB7A8K855 629 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 GYG2O15488 501 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 VAMP5O95183 116 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 THPOP40225 353 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 OSTNP61366 133 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 MMRN1Q13201 1228 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 VHLLQ6RSH7 139 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PIK3R3Q92569 461 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 BORCS5Q969J3 196 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 TP53INP1Q96A56 240 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 TAAR9Q96RI9 348 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 BCO2Q9BYV7 579 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 STOML1Q9UBI4 398 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ACOX3O15254 700 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CHADO15335 359 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 AVILO75366 819 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 KCNK5O95279 499 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PROZP22891 400 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CHMP24386 653 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 GRIN2CQ14957 1233 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 HKDC1Q2TB90 917 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 CUZD1Q86UP6 607 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 FAF2Q96CS3 445 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 C10orf90Q96M02 699 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 C7orf26Q96N11 449 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 PEBP4Q96S96 227 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 LGMNQ99538 433 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ZBTB18Q99592 522 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GTF2IP1-208ENST00000621948 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms