RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GRHL3	Q8TE85	626 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TM9SF4	Q92544	642 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	NDC1	Q9BTX1	674 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CTSF	Q9UBX1	484 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PDZD2	O15018	2839 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GX78	115 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FTH1	P02794	183 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PRF1	P14222	555 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ALAS2	P22557	587 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMA3	P25788	255 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338		Q0VFX4	171 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GRB7	Q14451	532 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ITIH4	Q14624	930 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	NKG7	Q16617	165 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC23	Q9UJX2	597 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT87P	A6NCN2	255 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRTM2	O43300	516 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	NRP2	O60462	931 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL41	O60662	606 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	MED26	O95402	600 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ONECUT2	O95948	504 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	CD63	P08962	238 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	GRIA3	P42263	894 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB28	P51157	221 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	FCRL6	Q6DN72	434 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF214	Q8ND24	703 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR54	Q9H977	334 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	QSOX1	O00391	747 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	DSCR3	O14972	297 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ZG16	O60844	167 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	CCR7	P32248	378 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1D4	P47884	311 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	PARP6	Q2NL67	630 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	DLG3	Q92796	817 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF778	Q96MU6	729 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	AGAP4	Q96P64	663 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-233	ENST00000602338	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.43	□□□□□ -0.58

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