RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 DCTN3O75935 186 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 UROSP10746 265 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 JUNDP17535 347 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PNLIPRP1P54315 467 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 NXPH1P58417 271 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF3Q13114 568 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TEAD4Q15561 434 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC30A9Q6PML9 568 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SYVN1Q86TM6 617 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52B6Q8NGF0 335 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 NELL1Q92832 810 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 GPRC5BQ9NZH0 403 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF15Q9UIH9 416 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A14Q9Y267 594 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAMP1O15126 338 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CRCPO75575 148 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CHEK2O96017 543 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 INHBCP55103 352 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDH1Q08174 1060 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT33BQ14525 404 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MAVSQ7Z434 540 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MILR1Q7Z6M3 343 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL4L1Q8NHW4 92 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CCT7Q99832 543 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SGPP1Q9BX95 441 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SUSD2Q9UGT4 822 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPS1Q9UHF7 1281 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF225Q9UK10 706 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KNL1Q8NG31 2342 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 E7ENX8 843 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 HGSO14964 777 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 UGDHO60701 494 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 GNSP15586 552 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 C21orf59P57076 290 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TAP2Q03519 686 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2A13Q16696 494 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX31Q8N9S9 440 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFPM2Q8WW38 1151 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PYCR2Q96C36 320 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMK1GQ96NX5 476 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MIPEPQ99797 713 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNA1EQ15878 2313 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KMT2EQ8IZD2 1858 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM131Q92545 1883 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GTW7 788 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT87PA6NCN2 255 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 IDH3AP50213 366 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOCQ15369 112 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT3A2Q3SY77 523 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 GGTA1PQ4G0N0 100 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMCX6Q7L4S7 300 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4F6Q8NGB9 312 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGCLL1Q8TB92 370 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MED8Q96G25 268 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MENTQ9BUN1 341 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TAAR2Q9P1P5 351 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM233B4DJY2 109 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4F21O95013 312 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVPABLB-1P60509 514 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP30.09■■■□□ 2.412e-14■■□□□ 13.1
CAPNS1-206ENST00000588815 TBPL1P62380 186 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PCBD2Q9H0N5 130 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MEAF6Q9HAF1 191 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNE2Q9Y6J6 123 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JNG1 304 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52A4PA6NMU1 304 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DS3K7RE56 304 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DIAPH2O60879 1101 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN9O95484 217 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 HGFP14210 728 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 EPORP19235 508 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPKAP23677 461 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKG2Q13237 762 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DS5Q14953 304 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN26Q16670 478 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PLK5Q496M5 336 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC6AQ6EIG7 209 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 LETMD1Q6P1Q0 360 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF165Q6ZSG1 346 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ACAD11Q709F0 780 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF8Q7Z7C8 310 aa30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms