RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-215	ENST00000586268	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SDHD	O14521	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCDC22	O60826	627 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR4F21	O95013	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CHEK2	O96017	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	WNT1	P04628	370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	EPOR	P19235	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SERPINB3	P29508	390 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	FNTB	P49356	437 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	BLK	P51451	505 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	FOXA1	P55317	472 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	NAE1	Q13564	534 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACAD11	Q709F0	780 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SGPP1	Q9BX95	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268		A6NCN8	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SCAMP1	O15126	338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	UGDH	O60701	494 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	HGF	P14210	728 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ITPKA	P23677	461 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCND1	P24385	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	NDUFS1	P28331	727 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACTR1B	P42025	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACTR1A	P61163	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	TBPL1	P62380	186 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	RPE65	Q16518	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	NRROS	Q86YC3	692 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCT6B	Q92526	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PYCR2	Q96C36	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCT7	Q99832	543 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-215	ENST00000586268	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.52	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms