RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581180.1

MKS1-210, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKS1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-210ENST00000581180 IMPA1P29218 277 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 KCNC1P48547 511 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 GFERP55789 205 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 AP1S2P56377 157 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PPP1CAP62136 330 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CDKL1Q00532 357 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 OR4D1Q15615 310 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 HES3Q5TGS1 186 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ANKS6Q68DC2 871 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZNF480Q8WV37 535 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CCDC138Q96M89 665 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZNF358Q9NW07 568 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 A0A1W2PPV9 198 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CCDC189A1A4V9 331 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 MT-ND3P03897 115 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PYGBP11216 843 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 KRT15P19012 456 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 HIST1H2ADP20671 130 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 KCNA4P22459 653 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 HSD17B2P37059 387 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PNLIPRP1P54315 467 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CASP8Q14790 479 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ACAP2Q15057 778 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 OR2A14Q96R47 310 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ALG9Q9H6U8 611 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 POMT2Q9UKY4 750 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CACNA1AO00555 2505 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 SEC16AO15027 2179 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PIPSLA2A3N6 862 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 E7ENX8 843 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 GOLGA8RI6L899 631 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 MATN2O00339 956 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 KERAO60938 352 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 THRAP10827 490 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CCKBRP32239 447 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 GLRBP48167 497 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TAP2Q03519 686 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 PRKAA1Q13131 559 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 KIR2DS3Q14952 304 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TGFBIQ15582 683 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ISXQ2M1V0 245 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 KRT71Q3SY84 523 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 IRGCQ6NXR0 463 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TRABD2AQ86V40 505 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 LCA5Q86VQ0 697 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 SMPDL3AQ92484 453 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 FBXL8Q96CD0 374 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 TGM7Q96PF1 710 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 ARL15Q9NXU5 204 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-210ENST00000581180 GSAPA4D1B5 854 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms