RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 KCTD6Q8NC69 237 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTDNEP1-202ENST00000570380 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTDNEP1-202ENST00000570380 GLOD4Q9HC38 313 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 CUTCQ9NTM9 273 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTDNEP1-202ENST00000570380 WFS1O76024 890 aa9.96□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MYBL2P10244 700 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 ITGAMP11215 1152 aa9.96□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 OLIG2Q13516 323 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 PDK2Q15119 407 aa9.96□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF766Q5HY98 468 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 CNSTQ6PJW8 725 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 KDELC1Q6UW63 502 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 MIEF2Q96C03 454 aa9.96□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.96□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ISM1B1AKI9 464 aa9.95□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TEX44Q53QW1 395 aa9.95□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.95□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.95□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF157Q96PX1 679 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 UCK2Q9BZX2 261 aa9.95□□□□□ -0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.95□□□□□ -0.82
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