RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC29A2Q14542 456 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHKG1Q16816 387 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPESP1Q6UW49 350 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 BMPERQ8N8U9 685 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP7Q93009 1102 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PAFAH2Q99487 392 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CTRCQ99895 268 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 APMAPQ9HDC9 416 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASCL3Q9NQ33 180 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM1AO60341 852 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC16A8O95907 504 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ST6GAL1P15907 406 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 STMN1P16949 149 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSMB5P28074 263 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 TPRP12270 2363 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGF2RP11717 2491 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1W2PPV9 198 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 C8GP07360 202 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOLR1P15328 257 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 GCAP28676 217 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB10P61026 200 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 TUBB4BP68371 445 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYP2A13Q16696 494 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKS6Q68DC2 871 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF480Q8WV37 535 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD180Q99467 661 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PARVBQ9HBI1 364 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 C9orf172C9J069 976 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 TAF4O00268 1085 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 MATN2O00339 956 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 INHBAP08476 426 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABHD2P08910 425 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 EBLN1P0CF75 366 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC166P0CW27 439 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 MSH2P43246 934 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 MC2RQ01718 297 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOXM1Q08050 763 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 DLG1Q12959 904 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIR2DS3Q14952 304 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZIC1Q15915 447 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAPH1Q70E73 1250 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC16A5O15375 505 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERGP11308 486 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYP2A7P20853 494 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 IMPA1P29218 277 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC5A2P31639 672 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PNLIPRP1P54315 467 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms