RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556402.5

ETFRF1-208, Transcript of electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, human

TSL 3 BASIC

Gene ETFRF1, Length 874 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	STX6	O43752	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	FGF17	O60258	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MOCS3	O95396	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CSF2RA	P15509	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CKMT2	P17540	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	GNAZ	P19086	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MARK3	P27448	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	GLIPR1	P48060	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	LHX1	P48742	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	UBASH3A	P57075	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	NSMAF	Q92636	917 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	FN3K	Q9H479	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402		A0A0G2JNG1	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	FMO6P	O60774	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLC22A3	O75751	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CDH1	P12830	882 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ANOS1	P23352	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	AHR	P35869	848 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MLLT10	P55197	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MEP1B	Q16820	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	GOSR1	O95249	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	WDPCP	O95876	746 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CSN3	P07498	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	CFC1	P0CG37	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	MCC	P23508	829 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	PTEN	P60484	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	UGCG	Q16739	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFRF1-208	ENST00000556402	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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