RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556210.1

CUX1-215, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CUX1, Length 4,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-215ENST00000556210 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TAMM41Q96BW9 452 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 BIRC8Q96P09 236 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 AIG1Q9NVV5 245 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 BMP10O95393 424 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 GSTM1P09488 218 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ETV3P41162 512 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 NTHL1P78549 312 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 OLAHQ9NV23 265 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TPST2O60704 377 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PGLSO95336 258 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 B3GALT4O96024 378 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 BMP1P13497 986 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 SMARCB1Q12824 385 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 IER5LQ5T953 404 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 AHSA2Q719I0 299 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 RRM2BQ7LG56 351 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PROSER1Q86XN7 944 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TMEM25Q86YD3 366 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CASD1Q96PB1 797 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TARM1B6A8C7 271 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PLK4O00444 970 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 FKTNO75072 461 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 BDKRB1P46663 353 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CCDC103Q8IW40 242 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TCF25Q9BQ70 676 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 MARCH5Q9NX47 278 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 IL17CQ9P0M4 197 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ATE1O95260 518 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TOR3AQ9H497 397 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 IGLV3-25P01717 112 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 IGFBP5P24593 272 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 SYT16Q17RD7 645 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CES5AQ6NT32 575 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ERAP2Q6P179 960 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CD320Q9NPF0 282 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.5□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 UNCXA6NJT0 531 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 H3BM21 787 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 KRT8P05787 483 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HMGCLP35914 325 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 SLC26A3P40879 764 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HK3P52790 923 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 NUDT6P53370 316 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TP53BP2Q13625 1128 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 APOFQ13790 326 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 KANK2Q63ZY3 851 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 STX19Q8N4C7 294 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ISL2Q96A47 359 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 RMI1Q9H9A7 625 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 KRT84Q9NSB2 600 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ADH1AP07327 375 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 RAP2AP10114 183 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 BCAP31P51572 246 aa14.49□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms