RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553486.5

ABCD4-218, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,842 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-218ENST00000553486 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 DHFR2Q86XF0 187 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 UCMAQ8WVF2 138 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 F5P12259 2224 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 OR2AG2A6NM03 316 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 FXYD1O00168 92 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 G6PDP11413 515 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 HLA-EP13747 358 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PSMC3P17980 439 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MAPK9P45984 424 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GNPDA1P46926 289 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SLC6A12P48065 614 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 BNIP2Q12982 314 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TLR1Q15399 786 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SYTL3Q4VX76 610 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ANO7Q6IWH7 933 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 VITQ6UXI7 678 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 USP7Q93009 1102 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 VPS33AQ96AX1 596 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TMEM159Q96B96 161 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 DTD2Q96FN9 168 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 COQ10AQ96MF6 247 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 HBEGFQ99075 208 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TRIM15Q9C019 465 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 NME4O00746 187 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SLC6A2P23975 617 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 IL12AP29459 219 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PRLHRP49683 370 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MESP2Q0VG99 397 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 FZD5Q13467 585 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 BLMHQ13867 455 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZNF234Q14588 700 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CPA6Q8N4T0 437 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ARRDC3Q96B67 414 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 FBXL8Q96CD0 374 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZBTB18Q99592 522 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 DYRK4Q9NR20 520 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SNX6Q9UNH7 406 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ITM2BQ9Y287 266 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 AP4S1Q9Y587 144 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CEP250Q9BV73 2442 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ASPDHA6ND91 283 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GSTM1P09488 218 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 JAK1P23458 1154 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GSTM4Q03013 218 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SFT2D3Q587I9 215 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SGO1Q5FBB7 561 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms