RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 FAM136AQ96C01 138 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 NDC1Q9BTX1 674 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ING2Q9H160 280 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 EPN3Q9H201 632 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 P2RY12Q9H244 342 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 SOX13Q9UN79 622 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CDYLQ9Y232 598 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 SCN2AQ99250 2005 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MAGEB16A2A368 324 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CTAGE9A4FU28 777 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 A6NL46 340 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 E5RI56 91 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 K7EM74 188 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZSCAN12O43309 604 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 HCRTR1O43613 425 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TMEM63AO94886 807 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CD63P08962 238 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MAGP20916 626 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PKLRP30613 574 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 GRIA3P42263 894 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 KLRB1Q12918 225 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 IL10RAQ13651 578 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 KCNJ11Q14654 390 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 NEPROQ6NW34 567 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CNSTQ6PJW8 725 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 DNAJC22Q8N4W6 341 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 IL17FQ96PD4 163 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TCF12Q99081 682 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.68□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 H3BMM5 538 aa8.67□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 ZNF185O15231 689 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 NIPSNAP2O75323 286 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 C1orf105O95561 183 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 S1PR4O95977 384 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ESR1P03372 595 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CTSBP07858 339 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CBSLP0DN79 551 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ARNTP27540 789 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 OTX2P32243 289 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CBSP35520 551 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PTGIRP43119 386 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 BDKRB1P46663 353 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PGDP52209 483 aa8.67□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 SLC9A5Q14940 896 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 NCF4Q15080 339 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PPP1R7Q15435 360 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 IGFBP7Q16270 282 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CPZQ66K79 652 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TTC27Q6P3X3 843 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 FIGLAQ6QHK4 219 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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