RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CDHR5Q9HBB8 845 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GRXCR2A6NFK2 248 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 E9PAM4 449 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 AP3D1O14617 1153 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PRKYO43930 277 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PMPCBO75439 489 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GRAP2O75791 330 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 AP2A1O95782 977 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 HLCSP50747 726 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TUBB3Q13509 450 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 MEIOBQ8N635 442 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 ARMC5Q96C12 935 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 BTF3L4Q96K17 158 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 KLK14Q9P0G3 267 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SUPT3HB4E1H0 165 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CHP2O43745 196 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ADAMTS4O75173 837 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 SNX4O95219 450 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 BEX3Q00994 111 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF235Q14590 738 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 METTL4Q8N3J2 472 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 U3KQV3 271 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 S100A8P05109 93 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 NNMTP40261 264 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CDH17Q12864 832 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 MPP7Q5T2T1 576 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 EGFL8Q99944 293 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 HES2Q9Y543 173 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 OAZ2O95190 189 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CCR1P32246 355 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 HNMTP50135 292 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CDH13P55290 713 aa5.93□□□□□ -1.46
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