RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PYCR2Q96C36 320 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRB-204ENST00000538708 C3orf18Q9UK00 162 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRB-204ENST00000538708 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 REP15Q6BDI9 236 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GHDCQ8N2G8 530 aa9.26□□□□□ -0.93
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