RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536265.5

DDX11-208, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 5

Gene DDX11, Length 3,603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-208	ENST00000536265	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	PEX1	O43933	1283 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	MT-ND1	P03886	318 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	IL6	P05231	212 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	PGR	P06401	933 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	METAP1	P53582	386 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	CHRNB3	Q05901	458 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	GPR180	Q86V85	440 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	GPR156	Q8NFN8	814 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	PRR35	P0CG20	571 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	PRPS2	P11908	318 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	FCGR1A	P12314	374 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	BCKDHA	P12694	445 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	MAPK9	P45984	424 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	ERVK-21	P61565	698 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	PWP1	Q13610	501 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	OR2T12	Q8NG77	320 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	GLMN	Q92990	594 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	CD300A	Q9UGN4	299 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	PSMD11	O00231	422 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	SLC16A8	O95907	504 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	GSTM1	P09488	218 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	HSD17B1	P14061	328 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	COX7A2	P14406	83 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF23	P17027	643 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	CKMT2	P17540	419 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	IL12A	P29459	219 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	SEC13	P55735	322 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	CDKL1	Q00532	357 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	GSTM4	Q03013	218 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	NUDT8	Q8WV74	236 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	YY1AP1	Q9H869	796 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-208	ENST00000536265	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	RFXAP	O00287	272 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	LDLR	P01130	860 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	PEX19	P40855	299 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	MESP2	Q0VG99	397 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	SGCG	Q13326	291 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	DUSP6	Q16828	381 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	PROSER1	Q86XN7	944 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	FBXO30	Q8TB52	745 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	RFXANK	O14593	260 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	SH3BP5	O60239	455 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	NPPA	P01160	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	TCF3	P15923	654 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	PDHA2	P29803	388 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	KLK6	Q92876	244 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	FXYD1	O00168	92 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	DFNA5	O60443	496 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-208	ENST00000536265	E2F6	O75461	281 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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