RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARSFP54793 590 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OCA2Q04671 838 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMPCAQ10713 525 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAN2A1Q16706 1144 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPINK14Q6IE38 97 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIAH3Q8IW03 269 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STT3BQ8TCJ2 826 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRMD6Q96NE9 622 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2A14Q96R47 310 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM7Q9C029 511 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL26Q9NPH9 171 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CUTCQ9NTM9 273 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GTH9 108 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DSCR3O14972 297 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCF4P15884 667 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL1R2P27930 398 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB6P35237 376 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTGS2P35354 604 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIA3P42263 894 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DL3P43628 341 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYCP1Q15431 976 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARSKQ6UWY0 536 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BEST3Q8N1M1 668 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAML1Q92585 1016 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX4I2Q96KJ9 171 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.71□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0J9YY10 115 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP27XA6NNY8 438 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ISM1B1AKI9 464 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFSD11O43934 449 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF24P17028 368 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOX5P35711 763 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLK7P49862 253 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EMP2P54851 167 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FANCCQ00597 558 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMRN1Q13201 1228 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAMLD1Q13495 774 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBA3CQ13748 450 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.869e-10■□□□□ 8.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1C1Q15619 314 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACAD10Q6JQN1 1059 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SARM1Q6SZW1 724 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MCOLN2Q8IZK6 566 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM57AQ8TBR7 257 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIB3Q96RU7 358 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP41Q9BYV8 373 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ICKQ9UPZ9 632 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.7□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.69□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASPDHA6ND91 283 aa9.69□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IDSB3KWA1 339 aa9.69□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNK1O00180 336 aa9.69□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ONECUT2O95948 504 aa9.69□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD46P15529 392 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms