RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 POLG2Q9UHN1 485 aa22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CPED1A4D0V7 1026 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPAN8P19075 237 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CCR10P46092 362 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 AP1S2P56377 157 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 YBX1P67809 324 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CES4AQ5XG92 561 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 GUSBP11Q6P575 273 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM20CQ8IXL6 584 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PADI4Q9UM07 663 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PROB1E7EW31 1015 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SH3BP5O60239 455 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 KLK8O60259 260 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CD59P13987 128 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 NDUFS1P28331 727 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ALDH4A1P30038 563 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 FASLGP48023 281 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PNLIPRP1P54315 467 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10G6Q8NH81 332 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXL8Q96CD0 374 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ACAT2Q9BWD1 397 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 OXSMQ9NWU1 459 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMB5P28074 263 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC18A1P54219 525 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 NAGLUP54802 743 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 NKAIN2Q5VXU1 208 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC38A3Q99624 504 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SRMSQ9H3Y6 488 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6C74A6NCV1 312 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 E7ENX8 843 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 BTN3A3O00478 584 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 BGNP21810 368 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PKLRP30613 574 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB28P51157 221 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKAA2P54646 552 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH13P55290 713 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1D5P58170 312 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CDKL1Q00532 357 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 TAP2Q03519 686 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SETDB1Q15047 1291 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 RDH11Q8TC12 318 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.02■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP6CO00743 305 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 LRP3O75074 770 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF883P0CG24 379 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1CAP62136 330 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 NR0B2Q15466 257 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 CHI3L2Q15782 390 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 RSC1A1Q92681 617 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 NEFHP12036 1026 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 GRK6P43250 576 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 TBPL1P62380 186 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 GUCY1A3Q02108 690 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 PERM1Q5SV97 790 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR47O94967 919 aa22■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP2A13Q16696 494 aa22■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 AMZ1Q400G9 498 aa22■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 UNC50Q53HI1 259 aa22■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 LIPMQ5VYY2 423 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms