RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498711.1

CLTC-209, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLTC, Length 2,941 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-209ENST00000498711 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 NEPROQ6NW34 567 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 CD300LGQ6UXG3 332 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ARMCX2Q7L311 632 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 CILP2Q8IUL8 1156 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 CBR4Q8N4T8 237 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 OR14C36Q8NHC7 312 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 LRRC58Q96CX6 371 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 MARK4Q96L34 752 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 CCDC115Q96NT0 180 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ATOH8Q96SQ7 321 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 RTP3Q9BQQ7 232 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 MROQ9BYG7 248 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ULBP1Q9BZM6 244 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 AIG1Q9NVV5 245 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 GID8Q9NWU2 228 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 CDH9Q9ULB4 789 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 RAXQ9Y2V3 346 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 EVPLQ92817 2033 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 PLXNA3P51805 1871 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 NLRC5Q86WI3 1866 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 A0A0J9YYE9 177 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 M0QX08 132 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 STX16O14662 325 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 PTGESO14684 152 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ARPC2O15144 300 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 PRLP01236 227 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 PGK2P07205 417 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 MMP3P08254 477 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 GNAO1P09471 354 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 NCAM1P13591 858 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 MATN1P21941 496 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 PCMT1P22061 227 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 TNFSF4P23510 183 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 AVPR1AP37288 418 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 PIK3CBP42338 1070 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 LHX1P48742 406 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 BMXP51813 675 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ESRRGP62508 458 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 RALGDSQ12967 914 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 RCAN2Q14206 197 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 TTC30BQ8N4P2 665 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 RNF148Q8N7C7 305 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 NETO2Q8NC67 525 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 GIPC3Q8TF64 312 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 SNX19Q92543 992 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 HDAC10Q969S8 669 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 MUL1Q969V5 352 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 C19orf60Q96EN9 201 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 ZNF599Q96NL3 588 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 G6PC3Q9BUM1 346 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 BTBD2Q9BX70 525 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 CERS4Q9HA82 394 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 PSME2Q9UL46 239 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 FADS3Q9Y5Q0 445 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 SNX11Q9Y5W9 270 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 PTPRDP23468 1912 aa3.85□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.84□□□□□ -1.79
CLTC-209ENST00000498711 NEMP2A6NFY4 417 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.9 ms