RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	CNST	Q6PJW8	725 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SEC14L1	Q92503	715 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	KCNJ9	Q92806	393 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	GPR87	Q9BY21	358 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	FAM60A	Q9NP50	221 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	MED16	Q9Y2X0	877 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SEC16A	O15027	2179 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CREG1	O75629	220 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	HBQ1	P09105	142 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ERG	P11308	486 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CHRM3	P20309	590 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	PAFAH1B1	P43034	410 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CCR10	P46092	362 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	BDKRB1	P46663	353 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	POLE2	P56282	527 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CTBP1	Q13363	440 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	GPR135	Q8IZ08	494 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	IL17F	Q96PD4	163 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ACTL8	Q9H568	366 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	STARD5	Q9NSY2	213 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	MEN1	O00255	615 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	KATNA1	O75449	491 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	MAG	P20916	626 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	PTPN4	P29074	926 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	C16orf46	Q6P387	395 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SYVN1	Q86TM6	617 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	MR1	Q95460	341 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	FAM136A	Q96C01	138 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC39	Q96DD0	335 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	RUFY1	Q96T51	708 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	GALP	Q9UBC7	116 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	POLH	Q9Y253	713 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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