RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NFS1Q9Y697 457 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 AK5Q9Y6K8 562 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SPEGQ15772 3267 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TLCD2A6NGC4 264 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF839A8K0R7 811 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 EFCAB7A8K855 629 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ARHGEF33A8MVX0 844 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MYO1CO00159 1063 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TAF4O00268 1085 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 BTN3A1O00481 513 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 BRINP1O60477 761 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PIAS1O75925 651 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TNFSF15O95150 251 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TSPAN12O95859 305 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CATP04040 527 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 C8GP07360 202 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 JMJD7P0C870 316 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CCL4P13236 92 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ITIH1P19827 911 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MCM3P25205 808 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PKLRP30613 574 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC26A3P40879 764 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ETV5P41161 510 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ABCG1P45844 678 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CSRP3P50461 194 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PMS2P54278 862 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RAB15P59190 212 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TAS2R39P59534 338 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PPP1CAP62136 330 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SP140Q13342 867 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 IL11RAQ14626 422 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CCSMST1Q4G0I0 132 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM164Q5U3C3 297 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ANKS6Q68DC2 871 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 DESI1Q6ICB0 168 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 IRGCQ6NXR0 463 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 LYPD8Q6UX82 237 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CEP97Q8IW35 865 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CTAGE3PQ8IX95 158 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CNPY4Q8N129 248 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 D2HGDHQ8N465 521 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PPM1NQ8N819 430 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MDM1Q8TC05 714 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 DLG3Q92796 817 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FGF11Q92914 225 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ELMO2Q96JJ3 720 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 UBXN10Q96LJ8 280 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC138Q96M89 665 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TAAR9Q96RI9 348 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CYTH2Q99418 400 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PKP4Q99569 1192 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NRTNQ99748 197 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MAP3K3Q99759 626 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZPBPQ9BS86 351 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 DDA1Q9BW61 102 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SPRY4Q9C004 299 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 XKR8Q9H6D3 395 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PARVBQ9HBI1 364 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms