RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492170.1

MRPL55-231, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 5

Gene MRPL55, Length 241 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-231	ENST00000492170	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CDYL	Q9Y232	598 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	LIAS	O43766	372 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MAG	P20916	626 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CCR7	P32248	378 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ESPL1	Q14674	2120 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MYBPC3	Q14896	1274 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC9A5	Q14940	896 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CYP2A13	Q16696	494 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	C4orf17	Q53FE4	359 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	IQCK	Q8N0W5	287 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	GALNT16	Q8N428	558 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PEX13	Q92968	403 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PTER	Q96BW5	349 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	EURL	Q9NYK6	297 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PCSK5	Q92824	1860 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	S1PR4	O95977	384 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	APOA4	P06727	396 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CTSB	P07858	339 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ARSF	P54793	590 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ACVR1	Q04771	509 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TMED2	Q15363	201 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF534	Q76KX8	674 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TM9SF4	Q92544	642 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF778	Q96MU6	729 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CARD6	Q9BX69	1037 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CASS4	Q9NQ75	786 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170		A0A1B0GX78	115 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SEMA7A	O75326	666 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	GPC4	O75487	556 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ALAS2	P22557	587 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	GRIA1	P42261	906 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	RPS6KA1	Q15418	735 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	VRK3	Q8IV63	474 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CCDC89	Q8N998	374 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	FKBP10	Q96AY3	582 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PAK5	Q9P286	719 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	IQCF5	A8MTL0	148 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	RASGRF2	O14827	1237 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ZSCAN12	O43309	604 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	APRT	P07741	180 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	UMOD	P07911	640 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CD9	P21926	228 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TTPA	P49638	278 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SEMA3A	Q14563	771 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TTC23L	Q6PF05	361 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		14.73	□□□□□ -0.05

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