RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 RPS6KA3P51812 740 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CASP9P55211 416 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GRM2Q14416 872 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TAB1Q15750 504 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NUDT13Q86X67 352 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 COX18Q8N8Q8 333 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SCAMP4Q969E2 229 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NECTIN3Q9NQS3 549 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C8orf4Q9NR00 106 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 H0YC42 278 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PTGESO14684 152 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 BCKDKO14874 412 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PGRMC2O15173 223 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 B3GALT2O43825 422 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GPR32O75388 356 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 FESP07332 822 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 HSD17B2P37059 387 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PGDP52209 483 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RPL26P61254 145 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OLR1P78380 273 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC5A9Q2M3M2 681 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PERM1Q5SV97 790 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ANO7Q6IWH7 933 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CILP2Q8IUL8 1156 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf82Q8WW14 230 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CRYGNQ8WXF5 182 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ART5Q96L15 291 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TSGA13Q96PP4 275 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CCM2Q9BSQ5 444 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 KIFC1Q9BW19 673 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PCDHAC1Q9H158 963 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.08□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 KLHL33A6NCF5 533 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ERI3O43414 337 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 UGT2B11O75310 529 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MYL9P24844 172 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ARMC3Q5W041 872 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GPR151Q8TDV0 419 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PXYLP1Q8TE99 480 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 LRTOMTQ8WZ04 291 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OTUB2Q96DC9 234 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC35G5Q96KT7 338 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TAC3Q9UHF0 121 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TEX28O15482 410 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TULP3O75386 442 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ADARP55265 1226 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RAPSNQ13702 412 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 HKDC1Q2TB90 917 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 IFI44LQ53G44 452 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RTP2Q5QGT7 225 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C1orf74Q96LT6 269 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DPYSL5Q9BPU6 564 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 B4DGG1 531 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM150CB9EJG8 249 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PITPNM1O00562 1244 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 XKRYO14609 159 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 LDB2O43679 373 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TPST2O60704 377 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NME6O75414 186 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ALOX5P09917 674 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PEX2P28328 305 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CAPGP40121 348 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DGKQP52824 942 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CCNIQ14094 377 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C6orf52Q5T4I8 152 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RNF220Q5VTB9 566 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 AGTRAPQ6RW13 159 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RPTNQ6XPR3 784 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TTLQ8NG68 377 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC3Q9BY71 257 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ANKHQ9HCJ1 492 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 LOC730098B7Z3J9 87 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 HAT1O14929 419 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ETS2P15036 469 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MPIP34949 423 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms