RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474025.1

SNRNP40-204, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 3

Gene SNRNP40, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-204	ENST00000474025		A0A0J9YY10	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025		A0A1B0GX78	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	KLHL18	O94889	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ALB	P02768	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	KRT1	P04264	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	RALB	P11234	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SSTR2	P30874	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SHMT2	P34897	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CA7	P43166	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	NR2C2	P49116	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TNFSF10	P50591	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	DYNLT1	P63172	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MPP3	Q13368	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	INA	Q16352	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	NKG7	Q16617	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	DLG3	Q92796	817 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	LMF1	Q96S06	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	COPS8	Q99627	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CCL21	O00585	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	DSCR3	O14972	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	KCNN4	O15554	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	USP1	O94782	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	UNC5C	O95185	931 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	HP	P00738	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	AGT	P01019	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ACPP	P15309	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ITGAL	P20701	1170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MAG	P20916	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	AGA	P20933	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ALAS2	P22557	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MCM3	P25205	808 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ACRV1	P26436	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MST1	P26927	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ACADL	P28330	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ADRA1A	P35348	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SOX11	P35716	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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