RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.97□□□□□ -1.61
OPTN-209ENST00000469025 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 CCDC69A6NI79 296 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 NEMP1O14524 444 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FRS3O43559 492 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ALOX12BO75342 701 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ONECUT2O95948 504 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FOLR1P15328 257 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 KELP23276 732 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 AK4P27144 223 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 GCH1P30793 250 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FOLR3P41439 243 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 MAPK9P45984 424 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ASCL1P50553 236 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PLK1P53350 603 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SLC12A1Q13621 1099 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 OR2Y1Q8NGV0 311 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SLC41A2Q96JW4 573 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SPATA13Q96N96 652 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 DACH2Q96NX9 599 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SERINC2Q96SA4 455 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PIF1Q9H611 641 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ALG6Q9Y672 507 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.96□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PRSS38A1L453 326 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ARHGEF35A5YM69 484 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 C2orf81A6NN90 581 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 VEGFDO43915 354 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PALMO75781 387 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 RASSF9O75901 435 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 LY86O95711 162 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 JCHAINP01591 159 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 HKR1P10072 659 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 TKTL1P51854 596 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ARFIP2P53365 341 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 WNT3AP56704 352 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 HILS1P60008 231 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PHC1P78364 1004 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 MTM1Q13496 603 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FAM189A2Q15884 450 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 WSCD2Q2TBF2 565 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 OR8K5Q8NH50 307 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 NCOA7Q8NI08 942 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PTERQ96BW5 349 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 TGM7Q96PF1 710 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 TRIB1Q96RU8 372 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 IL36AQ9UHA7 158 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ITM2BQ9Y287 266 aa4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FREM3P0C091 2139 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 OR5H15A6NDH6 313 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 LILRA5A6NI73 299 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 M0QZ24 198 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 AREL1O15033 823 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 TTI1O43156 1089 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 NRP2O60462 931 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 CDKL5O76039 1030 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 BEST1O76090 585 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 UMODP07911 640 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 CD63P08962 238 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 FAM163BP0C2L3 166 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 HK1P19367 917 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ACVR1BP36896 505 aa4.94□□□□□ -1.62
OPTN-209ENST00000469025 ARSEP51690 589 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.8 ms