RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466596.5

HS3ST3B1-202, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

TSL 2

Gene HS3ST3B1, Length 2,808 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-202ENST00000466596 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OPTCQ9UBM4 332 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 A0A1W2PQ67 120 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 E5RI56 91 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC16A6O15403 523 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RGS10O43665 173 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PGRP06401 933 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RHOQP17081 205 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ALOX12P18054 663 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AKT1P31749 480 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TGFBR2P37173 567 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SGSHP51688 502 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IL2P60568 153 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BHMTQ93088 406 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OR52E6Q96RD3 313 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DPY30Q9C005 99 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.65□□□□□ -0.06
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 A0A096LPI6 279 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 A8MX80 341 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VPS26AO75436 327 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HLA-DPA1P20036 260 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MSH3P20585 1137 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 S100A1P23297 94 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC6A4P31645 630 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PHC1P78364 1004 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SEMG2Q02383 582 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC14A1Q13336 389 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DSC3Q14574 896 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CPZQ66K79 652 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MON1AQ86VX9 555 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CCDC103Q8IW40 242 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TEX26Q8N6G2 289 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SCN3BQ9NY72 215 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 M0R129 80 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AREL1O15033 823 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ASNA1O43681 348 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KLK8O60259 260 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MC4RP32245 332 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CYP4F2P78329 520 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TP53BP2Q13625 1128 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GTF2H2Q13888 395 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RGMBQ6NW40 437 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LINGO4Q6UY18 593 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATL1Q8WXF7 558 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZBTB18Q99592 522 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PER2O15055 1255 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NUAK1O60285 661 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ELNP15502 786 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GRK5P34947 590 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CA5AP35218 305 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MADCAM1Q13477 382 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SERINC3Q13530 473 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MBTPS1Q14703 1052 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RNF175Q8N4F7 328 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PROX1Q92786 737 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TADA1Q96BN2 335 aa14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms