RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 APMAPQ9HDC9 416 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PDE7BQ9NP56 450 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 FGF21Q9NSA1 209 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 SLC39A10Q9ULF5 831 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 KLK4Q9Y5K2 254 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PSAT1Q9Y617 370 aa11.68□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 A0A0J9YY10 115 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ESYT3A0FGR9 886 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ARHGEF33A8MVX0 844 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 STMND1H3BQB6 276 aa11.67□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 SLC16A5O15375 505 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 MAP3K7O43318 606 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ZBTB14O43829 449 aa11.67□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 ARL4DP49703 201 aa11.67□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 CDKN2DP55273 166 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TUBB4BP68371 445 aa11.67□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 RAB42Q8N4Z0 105 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 CDKL2Q92772 493 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 NKD1Q969G9 470 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TCTN2Q96GX1 697 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 OR6C1Q96RD1 312 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 NDNQ99608 321 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 CPNE1Q99829 537 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 FUT8Q9BYC5 575 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 SLC17A6Q9P2U8 582 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.67□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 A0A1W2PPV9 198 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ZNF839A8K0R7 811 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ISM1B1AKI9 464 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TARM1B6A8C7 271 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 KLK10O43240 276 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TSPAN12O95859 305 aa11.66□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 IL17FQ96PD4 163 aa11.66□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.66□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 STK17BO94768 372 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 C8GP07360 202 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 EBLN1P0CF75 366 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PVRP15151 417 aa11.65□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 GP5P40197 560 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 BDKRB1P46663 353 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TAS2R39P59534 338 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 POU4F1Q01851 419 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ABHD18Q0P651 414 aa11.65□□□□□ -0.54
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HPS1-206ENST00000462743 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TUBB3Q13509 450 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 CUL1Q13616 776 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 KCNAB1Q14722 419 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TGIF1Q15583 401 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ZIC1Q15915 447 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 GRTP1Q5TC63 336 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 CCDC25Q86WR0 208 aa11.65□□□□□ -0.54
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