RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PGAM4Q8N0Y7 254 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 STK40Q8N2I9 435 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NTAN1Q96AB6 310 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DKKL1Q9UK85 242 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MROH5Q6ZUA9 1318 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MMP20O60882 483 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SCGB2A1O75556 95 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UGT2B17O75795 530 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GATBO75879 557 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CIAO1O76071 339 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 C1QBP02746 253 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PCCBP05166 539 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CKMP06732 381 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ASGR1P07306 291 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 AHCYP23526 432 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA2P54652 639 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPX6P59796 221 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RAB8AP61006 207 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACTA2P62736 377 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACTG2P63267 376 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACTC1P68032 377 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACTA1P68133 377 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 VAMP3Q15836 100 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CES4AQ5XG92 561 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RDH13Q8NBN7 331 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR2T34Q8NGX1 318 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR2T3Q8NH03 318 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PWWP2AQ96N64 755 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NPAS2Q99743 824 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 APBA2Q99767 749 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZPBPQ9BS86 351 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FBRSQ9HAH7 460 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 POLLQ9UGP5 575 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR5K3A6NET4 321 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GJE1A6NN92 205 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFS3O75489 264 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LRIG2O94898 1065 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HRGP04196 525 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LHCGRP22888 699 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NR2F2P24468 414 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A4P31645 630 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GSK3AP49840 483 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPR143P51810 404 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MLLT10P55197 1068 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FAAP100Q0VG06 881 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CLINT1Q14677 625 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PDK2Q15119 407 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SYNE4Q8N205 404 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A6Q92536 515 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KAT5Q92993 513 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LGALS12Q96DT0 336 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FEM1AQ9BSK4 669 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IL17BQ9UHF5 180 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MED23Q9ULK4 1368 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LNP1A1A4G5 178 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LEUTXA8MZ59 168 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEB2O15479 319 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 AKR7A2O43488 359 aa5.48□□□□□ -1.53
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