RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIAS2O75928 621 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 INMTO95050 263 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASAL1O95294 804 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGSF6O95976 241 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCCBP05166 539 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PROS1P07225 676 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF883P0CG24 379 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKT2P31751 481 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGRP47804 291 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACADVLP49748 655 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCR5P51681 352 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKAG1P54619 331 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPM4P67936 248 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTA1Q13330 715 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC14A1Q13336 389 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAMLD1Q13495 774 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF4Q15306 451 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF284Q2VY69 593 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP58Q5T655 872 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 HES3Q5TGS1 186 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 HORMAD1Q86X24 394 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 LNX2Q8N448 690 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2AP1Q8NGE2 309 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 NTAN1Q96AB6 310 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNPY3Q9BT09 278 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYT11Q9BT88 431 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTRT3Q9BYD9 372 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PREBQ9HCU5 417 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNKQ9P0W0 207 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 LHX3Q9UBR4 397 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 FZD10Q9ULW2 581 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPCAL4Q9UM19 191 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATRXP46100 2492 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIPSLA2A3N6 862 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLON5A6NGN9 336 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 AQP7P3A6NL99 342 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MX80 341 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 J3KR12 359 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM38O00635 465 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASC3O15234 703 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF14O43557 240 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD11O43934 449 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPSAP2O60256 369 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRCH4O75427 683 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCEA3O75764 348 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD160O95971 181 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSRP00390 522 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC4A1P02730 911 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 GYPCP04921 128 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC172P0C7W6 258 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIPP30301 263 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH9A1P49189 494 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 THOP1P52888 689 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBASH3AP57075 661 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAXP61244 160 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM14Q14142 442 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT81Q14533 505 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF235Q14590 738 aa4.42□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms