RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 IFNEQ86WN2 208 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 LILRA2Q8N149 483 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 S1PR5Q9H228 398 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf109Q9NX04 203 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 SNX6Q9UNH7 406 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 NUMA1Q14980 2115 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ARNTLO00327 626 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PCCBP05166 539 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 GALK1P51570 392 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R38P59533 333 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 CST6Q15828 149 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 BCL7AQ4VC05 210 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM125Q96AQ2 219 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 FOPNLQ96NB1 174 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 E7EQ34 232 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 CD22P20273 847 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 JAK1P23458 1154 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 IMPA1P29218 277 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM15Q13444 863 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 GTF2H3Q13889 308 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 SFT2D3Q587I9 215 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 XKR5Q6UX68 686 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 DHFR2Q86XF0 187 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC138Q96M89 665 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 NPC1O15118 1278 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 POP7O75817 140 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1B2P21281 511 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 IRF8Q02556 426 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 NFE2L1Q14494 772 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 XKR6Q5GH73 641 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 AGBL4Q5VU57 503 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 RNF165Q6ZSG1 346 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 OR4K3Q96R72 315 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PKP2Q99959 881 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 GDF15Q99988 308 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PIF1Q9H611 641 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PP55 124 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 FRG2Q64ET8 278 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 RAB7BQ96AH8 199 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 HIC2Q96JB3 615 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 LRGUKQ96M69 825 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PPM1MQ96MI6 270 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 FRG2BQ96QU4 278 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 BCKDHAP12694 445 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 GRIA3P42263 894 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 FOXM1Q08050 763 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0040Q15053 153 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 C2orf27AQ580R0 203 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 LGR4Q9BXB1 951 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 NANOGQ9H9S0 305 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 RIMS3Q9UJD0 308 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PRR23AA6NEV1 266 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf105O95561 183 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 C8BP07358 591 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 AQP4P55087 323 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 RHDQ02161 417 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 CMPK2Q5EBM0 449 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 DPY30Q9C005 99 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 CLDND1Q9NY35 253 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 CROCCQ5TZA2 2017 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 K7EQS6 105 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 JUPP14923 745 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRE1Q14246 886 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 SPANXN4Q5MJ08 99 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ATL1Q8WXF7 558 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 APIPQ96GX9 242 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB18Q99592 522 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms