RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CPNE9Q8IYJ1 553 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CD200R1Q8TD46 325 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PYROXD1Q8WU10 500 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL42Q9P2K6 505 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM208BQ5VWN6 2430 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0J9YY10 115 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF33A8MVX0 844 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 LIFP15018 202 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MCM3P25205 808 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CDKN2DP55273 166 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MGAT5Q09328 741 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 C8orf74Q6P047 294 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PALM2Q8IXS6 379 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGEC3Q8TD91 643 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM60AQ9NP50 221 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL20Q9Y2M5 609 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MGAQ8IWI9 3026 aa24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM150CB9EJG8 249 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZIC1Q15915 447 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC25Q86WR0 208 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM126BQ8IUX1 230 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB42Q8N4Z0 105 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ESX1Q8N693 406 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 GPATCH11Q8N954 259 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 DENND1AQ8TEH3 1009 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TWSG1Q9GZX9 223 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 FANCEQ9HB96 536 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TAS2R13Q9NYV9 303 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFATQ9P243 1243 aa24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ESYT3A0FGR9 886 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CATP04040 527 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MPC1LP0DKB6 136 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PGGT1BP53609 377 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CBLBQ13191 982 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SF1Q15637 639 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC5A12Q1EHB4 618 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 UGT3A1Q6NUS8 523 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CYHR1Q6ZMK1 362 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 NEK10Q6ZWH5 1172 aa24.12■■□□□ 1.45
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HTATSF1-202ENST00000425695 OR9A1PQ8NGU1 263 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 OR1L3Q8NH93 324 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO25Q8TCJ0 367 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 FCRL4Q96PJ5 515 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PSAT1Q9Y617 370 aa24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SCRG1O75711 98 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PIAS1O75925 651 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBB4AP04350 444 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SSTR1P30872 391 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CAV1Q03135 178 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ABHD18Q0P651 414 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 DEFB110Q30KQ9 67 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 HECTD2Q5U5R9 776 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PAQR3Q6TCH7 311 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZDHHC24Q6UX98 284 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 GALNT7Q86SF2 657 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC22A18Q96BI1 424 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TCTN2Q96GX1 697 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PKP4Q99569 1192 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNYL3P0C7X3 344 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CBSLP0DN79 551 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGP20916 626 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PSMB5P28074 263 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CBSP35520 551 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP4F2P78329 520 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP7Q14244 749 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 STRA8Q7Z7C7 330 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 OR8K5Q8NH50 307 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ASB11Q8WXH4 323 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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