RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.33■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 GALNT10Q86SR1 603 aa20.33■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 NXPE1Q8N323 547 aa20.33■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 STON2Q8WXE9 905 aa20.33■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ITPKCQ96DU7 683 aa20.33■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 CCDC138Q96M89 665 aa20.33■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 EBPLQ9BY08 206 aa20.33■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 H7C0S8 307 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 B4GALNT1Q00973 533 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 PTSQ03393 145 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 IQCF2Q8IXL9 164 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 CHID1Q9BWS9 393 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 HIDE1A8MVS5 230 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 B4GAT1O43505 415 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 EFEMP2O95967 443 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ZBED5Q49AG3 693 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 NCLNQ969V3 563 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 MARCH7Q9H992 704 aa20.32■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TOR1BO14657 336 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 GLUD1P00367 558 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 COPS8Q99627 209 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 RABL2BQ9UNT1 228 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 FAM234BA2RU67 622 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 VPS4BO75351 444 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 HSD17B1P14061 328 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TACR1P25103 407 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 DPY30Q9C005 99 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TRIM15Q9C019 465 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 WDR70Q9NW82 654 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 VPS4AQ9UN37 437 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 EPB42P16452 691 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 LAPTM4AQ15012 233 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 Q6ZVL8 140 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 CACUL1Q86Y37 369 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 C10orf111Q8N326 155 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ADI1Q9BV57 179 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 BRD9Q9H8M2 597 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 HPS4Q9NQG7 708 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.31■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TMEM202A6NGA9 273 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 DLGAP1O14490 977 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 HSPA13P48723 471 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 NHSL2Q5HYW2 709 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 CGREF1Q99674 301 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 CD244Q9BZW8 370 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 KNL1Q8NG31 2342 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 GSTA4O15217 222 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 STK16O75716 305 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 WDR47O94967 919 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 MLLT10P55197 1068 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ABRQ12979 859 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 USP43Q70EL4 1123 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 ITIH5Q86UX2 942 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TRPV3Q8NET8 790 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.3■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.29■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.29■□□□□ 0.84
SPRN-201ENST00000414069 AXIN1O15169 862 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms