RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRASO14807 208 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MGST3O14880 152 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCLK1O15075 740 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBDO15205 165 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 AKAP10O43572 662 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CACNG3O60359 315 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 KATNA1O75449 491 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SUPT7LO94864 414 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZFPL1O95159 310 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RASAL1O95294 804 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MATN4O95460 622 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 C22orf31O95567 290 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CPNE6O95741 557 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 HPRP00739 348 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 F9P00740 461 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGLV2-14P01704 120 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 AMY1AP04745 511 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALOX5P09917 674 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CPEP16870 476 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GOT1P17174 413 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYP2B6P20813 491 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FASP25445 335 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADORA2AP29274 412 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 EPHA3P29320 983 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 AXLP30530 894 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MLH1P40692 756 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRIA1P42261 906 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLCN5P51795 746 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NAGLUP54802 743 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 HMGCS2P54868 508 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PKNOX1P55347 436 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDKL1Q00532 357 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MS4A2Q01362 244 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GALNT2Q10471 571 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CBX3Q13185 183 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SEMA3BQ13214 749 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYTH1Q15438 398 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MOGQ16653 247 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MTX3Q5HYI7 312 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NOMO2Q5JPE7 1267 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCID2Q5JVF3 399 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GLRA4Q5JXX5 417 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 IL23RQ5VWK5 629 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 REP15Q6BDI9 236 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NXNQ6DKJ4 435 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NIPAL1Q6NVV3 410 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 IYDQ6PHW0 289 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 BEND5Q7L4P6 421 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF567Q8N184 647 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SCML4Q8N228 414 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTC30BQ8N4P2 665 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 AADATQ8N5Z0 425 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC185Q8N715 623 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 BEST2Q8NFU1 509 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBA3Q8TBC4 463 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAPK15Q8TD08 544 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NELL1Q92832 810 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PEX13Q92968 403 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ISOC1Q96CN7 298 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 L3HYPDHQ96EM0 354 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FEM1CQ96JP0 617 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RANBP9Q96S59 729 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NPY6RQ99463 290 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LGMNQ99538 433 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms