RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCL6P80162 114 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARID5AQ03989 594 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLD1Q13393 1074 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGTLC2Q14390 218 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSHL1Q14406 222 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM83EQ2M2I3 478 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL26Q53HC5 615 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NHSL2Q5HYW2 709 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO47Q5MNV8 452 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM198Q66K66 360 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa-1.24□□□□□ -2.61
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RNU6-172P-201ENST00000411000 Q75L30 129 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALNT7Q86SF2 657 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN4BQ8IWT1 228 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPXM2Q8N436 756 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GBGT1Q8N5D6 347 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP38Q8NB14 1042 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MDS2Q8NDY4 140 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GJC3Q8NFK1 279 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR52B6Q8NGF0 335 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM170AQ8WVE7 144 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
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RNU6-172P-201ENST00000411000 JDP2Q8WYK2 163 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEPDC7Q96QD5 511 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCT8L2Q96SF2 557 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RETNLBQ9BQ08 111 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM173AQ9BQD7 235 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMT1Q9H993 441 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 VPS37BQ9H9H4 285 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D17Q9HA65 648 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NECTIN3Q9NQS3 549 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIRT7Q9NRC8 400 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OLFML3Q9NRN5 406 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A11Q9NSA0 550 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOHLH2Q9NX45 425 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNTG2Q9NY99 539 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR6C2Q9NZP2 312 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIRPGQ9P1W8 387 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMCX1Q9P291 453 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXL2Q9UKC9 423 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 YIPF1Q9Y548 306 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN16Q9Y5I7 305 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 EID1Q9Y6B2 187 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX264Q9Y6I9 313 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP-1.24□□□□□ -2.61
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RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PPL8 197 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPB2A8KAH6 182 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 K7ESF4 209 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHHO43323 396 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 COQ9O75208 318 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAIAP3O94812 1187 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEMA4FO95754 770 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPNP05981 417 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOXF2BP0C7M4 288 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADRA2CP18825 462 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 UGT1A6P19224 532 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 AOC1P19801 751 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CAV2P51636 162 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARSFP54793 590 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF5P55010 431 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB1AP62820 205 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHODHQ02127 395 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MADCAM1Q13477 382 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPYSQ14117 519 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPB2Q16082 182 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DECR1Q16698 335 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 C18orf63Q68DL7 685 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL34Q6ZMJ4 242 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF554Q86TJ5 538 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTOV1Q86YD1 416 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 LURAP1LQ8IV03 231 aa-1.25□□□□□ -2.61
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